Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms