Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD40LGP29965 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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