Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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