Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms