Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms