Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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