Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSFQ9UBX1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms