Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms