Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms