Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIF1Q9H611 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms