Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms