Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms