Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms