Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF439Q8NDP4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF439Q8NDP4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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