Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms