Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms