Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms