Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBAP2Q5T6F2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms