Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms