Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms