Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms