Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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