Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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