Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms