Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGA9Q13797 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGA9Q13797 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGA9Q13797 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ITGA9Q13797 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ITGA9Q13797 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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