Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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