Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.29e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DIABLO-209ENST00000474004 804 ntTSL 27.52□□□□□ -1.219e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.359e-8■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.535e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 28.1□□□□□ -1.115e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.766e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 423.63■■□□□ 1.377e-17■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.067e-17■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.964e-64■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 218.66■□□□□ 0.586e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.566e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 517.34■□□□□ 0.376e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.296e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.316e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.686e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 NUP98-207ENST00000429801 2541 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.856e-7■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-13■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-13■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-13■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-13■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 TPT1-213ENST00000533567 594 ntTSL 34.42□□□□□ -1.71e-45■■□□□ 12
PABPC4Q13310 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 29.73□□□□□ -0.853e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.832e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.772e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.427e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.262e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)28.15■■■□□ 2.17e-6■■□□□ 12
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