Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCAPQ12770 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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