Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms