Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms