Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms