Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms