Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms