Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CAPGP40121 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms