Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARGP37231 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms