Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPRR1AP35321 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms