Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPI1P17947 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPI1P17947 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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