Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms