Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms