Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED1O96006 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms