Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms