Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN3Q9P232 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms