Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms