Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms