Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms