Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms