Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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