Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIC2Q96JB3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms