Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGF29Q96ES7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms