Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HGDQ93099 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms